Protein–RNA interactions for Protein: O43325

LYRM1, LYR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYRM1O43325 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM1O43325 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM1O43325 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM1O43325 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM1O43325 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM1O43325 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM1O43325 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM1O43325 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM1O43325 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM1O43325 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM1O43325 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM1O43325 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM1O43325 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM1O43325 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM1O43325 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM1O43325 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM1O43325 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM1O43325 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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LYRM1O43325 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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LYRM1O43325 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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LYRM1O43325 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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LYRM1O43325 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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LYRM1O43325 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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LYRM1O43325 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM1O43325 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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