Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SOCS1O15524 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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