Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNMO15061 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNMO15061 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNMO15061 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNMO15061 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNMO15061 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNMO15061 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNMO15061 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNMO15061 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNMO15061 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNMO15061 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNMO15061 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNMO15061 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNMO15061 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNMO15061 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNMO15061 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNMO15061 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNMO15061 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNMO15061 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNMO15061 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNMO15061 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNMO15061 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNMO15061 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNMO15061 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNMO15061 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNMO15061 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNMO15061 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNMO15061 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNMO15061 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNMO15061 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNMO15061 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNMO15061 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNMO15061 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNMO15061 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNMO15061 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNMO15061 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNMO15061 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNMO15061 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNMO15061 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNMO15061 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNMO15061 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNMO15061 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNMO15061 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNMO15061 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNMO15061 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNMO15061 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNMO15061 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNMO15061 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNMO15061 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNMO15061 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNMO15061 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNMO15061 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNMO15061 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNMO15061 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNMO15061 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNMO15061 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNMO15061 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNMO15061 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNMO15061 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNMO15061 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNMO15061 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNMO15061 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNMO15061 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNMO15061 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNMO15061 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNMO15061 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNMO15061 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNMO15061 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNMO15061 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNMO15061 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNMO15061 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNMO15061 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNMO15061 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNMO15061 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNMO15061 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNMO15061 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNMO15061 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNMO15061 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNMO15061 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNMO15061 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNMO15061 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNMO15061 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNMO15061 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNMO15061 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNMO15061 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNMO15061 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNMO15061 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNMO15061 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNMO15061 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNMO15061 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNMO15061 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNMO15061 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNMO15061 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNMO15061 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNMO15061 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNMO15061 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNMO15061 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNMO15061 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNMO15061 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNMO15061 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms