Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
J3QR89 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
J3QR89 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
J3QR89 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 NAV2-204ENST00000396087 7882 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 SMIM10L1-201ENST00000622602 4795 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
J3QR89 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
J3QR89 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
J3QR89 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
J3QR89 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
J3QR89 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
J3QR89 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
J3QR89 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
J3QR89 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
J3QR89 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
J3QR89 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
J3QR89 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
J3QR89 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
J3QR89 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
J3QR89 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
J3QR89 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
J3QR89 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
J3QR89 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
J3QR89 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
J3QR89 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
J3QR89 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
J3QR89 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
J3QR89 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
J3QR89 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
J3QR89 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
J3QR89 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
J3QR89 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
J3QR89 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
J3QR89 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
J3QR89 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
J3QR89 ACSS3-203ENST00000548058 9254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
J3QR89 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
J3QR89 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
J3QR89 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
J3QR89 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms