Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms