Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8JA6NMD2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOLGA8JA6NMD2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms