Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PRAMEF25A6NGN4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF25A6NGN4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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