Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEMP2A6NFY4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms