Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms