Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms