Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms