Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI40

SLC24A2, Sodium/potassium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A2Q9UI40 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC24A2Q9UI40 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms