Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms