Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms