Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms