Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms