Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG3Q9NT62 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms