Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF275Q9NSD4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms