Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT82Q9NSB4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms