Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC22A11Q9NSA0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC22A11Q9NSA0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC22A11Q9NSA0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC22A11Q9NSA0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC22A11Q9NSA0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms