Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
UBQLN4Q9NRR5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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