Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms