Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPR88Q9GZN0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPR88Q9GZN0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPR88Q9GZN0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPR88Q9GZN0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPR88Q9GZN0 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPR88Q9GZN0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPR88Q9GZN0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPR88Q9GZN0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPR88Q9GZN0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPR88Q9GZN0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GPR88Q9GZN0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPR88Q9GZN0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPR88Q9GZN0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPR88Q9GZN0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPR88Q9GZN0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GPR88Q9GZN0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GPR88Q9GZN0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPR88Q9GZN0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPR88Q9GZN0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPR88Q9GZN0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPR88Q9GZN0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPR88Q9GZN0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPR88Q9GZN0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPR88Q9GZN0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPR88Q9GZN0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPR88Q9GZN0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPR88Q9GZN0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPR88Q9GZN0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPR88Q9GZN0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPR88Q9GZN0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPR88Q9GZN0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GPR88Q9GZN0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms