Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms