Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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FOXQ1Q9C009 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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FOXQ1Q9C009 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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FOXQ1Q9C009 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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FOXQ1Q9C009 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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FOXQ1Q9C009 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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