Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC46A2Q9BY10 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms