Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms