Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms