Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms