Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms