Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms