Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SPOCK3Q9BQ16 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SPOCK3Q9BQ16 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SPOCK3Q9BQ16 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 VAX1-201ENST00000277905 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPOCK3Q9BQ16 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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