Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms