Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms