Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms