Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HDAC11Q96DB2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HDAC11Q96DB2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HDAC11Q96DB2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HDAC11Q96DB2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC11Q96DB2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC11Q96DB2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC11Q96DB2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC11Q96DB2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC11Q96DB2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC11Q96DB2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC11Q96DB2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC11Q96DB2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC11Q96DB2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC11Q96DB2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC11Q96DB2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC11Q96DB2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC11Q96DB2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms