Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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