Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKD2Q969F2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms