Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRG4Q92954 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PRG4Q92954 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PRG4Q92954 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PRG4Q92954 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRG4Q92954 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PRG4Q92954 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRG4Q92954 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRG4Q92954 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PRG4Q92954 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRG4Q92954 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRG4Q92954 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRG4Q92954 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PRG4Q92954 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRG4Q92954 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRG4Q92954 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRG4Q92954 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRG4Q92954 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRG4Q92954 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRG4Q92954 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRG4Q92954 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRG4Q92954 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRG4Q92954 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRG4Q92954 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms