Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms