Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms