Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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SYNE4Q8N205 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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SYNE4Q8N205 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNE4Q8N205 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SYNE4Q8N205 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SYNE4Q8N205 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SYNE4Q8N205 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SYNE4Q8N205 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SYNE4Q8N205 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNE4Q8N205 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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