Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms