Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms