Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
KNDC1Q76NI1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KNDC1Q76NI1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms