Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP31Q70CQ4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms