Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC149Q6ZUS6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms