Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms