Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGP8Q6NSW7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms