Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CARMIL2Q6F5E8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CARMIL2Q6F5E8 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms